通常对于一个经费不是那么充足
，
，，，即没什么经费的计算模拟课题组来说（我没说我组，，没说），，，，究竟整几台服务器是个大问题。。。服务器的使用又经常会出现以组会为周期特征，，以审稿意见为诱发因子的使用高峰期，，和相应的低峰期，，
，难以互补
。。。故而云超算平台就可以作为很好的润滑剂来使用。。因此，，，步入科研生活之初，，，我就遍求天下超算，，，，终于发现了宝藏云——世纪高清云。。。
。

世纪高清云能够基本满足一切我等对超算的幻想，
，
，
，对于导师来说，，，，最重要的肯定是便宜
，，，，便宜，，，，和便宜；对于学生来说，，最重要的则是简单，，，简单，，傻瓜式的简单
。。。
。

前者我们可以在后续的计算中管窥一斑
，，后者，，
，大家点开世纪高清云的主页注册一下
，，登录控制台看一看就知道了。。所有过程都是点一点、、拖一拖
，
，
，，无脑式完成。
。。
。并且注册所赠送的算力金
，
，
，真的够计算出不少东西的。
。。改变了我对超算存有过的偏见
。。。。

在本文中，，，我来做一系列简单的声子谱和分析，，，来为大家演示在宝藏云中一站式科研的全过程。
。
。。对于材料模拟来说
，，确定它的动力学稳定性是非常关键的一点。。。声子谱G点下的小小虚频
，，，，也是无数人的噩梦。。
。但实际上即便是计算“出错”的声子谱，，也是包含很多信息的，，这一点我还尚在学习
，，将一点心得与此计算过程一切记录下来。。。。

我们来计算三维体材料ZnO在常压下和19Gpa静水压下的声子谱，，，，每一个声子谱计算对他进行k点的测试，，，
，最后我们将声子谱对不同原子进行投影，，，进一步分析他的晶格振动情况。。。
。

a) 建模：正巧在进行试算的时候重装了系统，，，一时半会没有MS用，，，，所以建模则在世纪高清云的windows工作站节点下运行。。进行计算的是六角纤锌矿结构Zn0（P63mc）

相当的酷炫，，，也很流畅，
，，，对于我来说，，，MS只用来建模，，所以装一个几个G的东西，，，，很划不来，
，，调用一个4核节点，，一小时3毛2，，，我一度想尝试安装一个自定义软件试试
。
。（譬如荒野大镖客）

a) 常压优化INCAR 与 晶格常数

晶格常数：3.165（a、、、、b）
，，5.106（c）

b) 190Gpa INCAR 与 晶格常数。。

晶格常数
：3.165（a、、、b）
，，，5.106（c）

我专门上vasp论坛看过，，静水压的单位KB = 0.1Gpa。。。。(见附件
，，可以找大鱼获取)

对两种晶格，
，，，按网传的10埃米原理，，，进行3-4-2的扩胞
，，，共96个原子。
。

对得到的超胞在1x1x1,2x2x2,3x3x3点网格下进行声子谱计算，
，，以查看其收敛情况。
。声子谱输入文件如下
：

在进行1x1x1（即单G点）计算时，，我们可以采取单G点版本来计算，，，以缩短计算时间。。
。。只要简单的把提交任务脚本中的vasp_std 修改为 vasp_gam。。。。(记得在计算更大k点的时候要调回来)，，另外涂抹方案如-5，，，是不支持低k点计算的
。。。

真正开展计算的时候，，，这96原子的单点计算，，我调用了一个64核的节点，，20分钟左右就算完了
，，，，全部的六个算完抛去失误算错的部分只在百元附近。。

a）在计算所得的声子谱目录下，，调用phonphy
，，提取力常数

phonopy --fc vasprun.xml

b）再编写bond.conf文件
，，，并键入命令，，，获得band.yaml文件

文件

ATOM_NAME =Zn O

DIM = 3 4 2

NPOINTS = 301

BAND = 0.000000 0.000000 0.000000  0.000000 0.000000 0.500000  0.333333 0.3333333  0.000000  0.000000 0.000000 0.000000

FORCE_CONSTANTS = READ

EIGENVECTORS = .TRUE.

BAND_POINTS = 301

命令如下：

phonopy --dim="3 4 2" -c POSCAR-unitcell -p band.conf

c）此时
，
，，我们调用后处理神器vaspkit1.12，
，
，调用73-739,得到声子谱在各原子中的权重。。。。

d）这时，
，，，我们暂时先不管权重，，绘制普通的声子谱
。。

可以看到三个k点所计算出的声子谱基本叠在一起
，，，，不放大几乎不能分辨
，，，说明此时的收敛程度还是不错的
。。。。在19Gpa压强下
，
，声子谱的样式并无太大变化
，，，，而是整体“升高”了许多，，，，说明此时他还是稳定的，
，，，某学报上刊登的文章计算出19Gpa下有围绕在g点附近的小虚频
，，我认为可能是收敛问题
，
，或者是泛函问题。。

这里的结果也说明，，大多数情况下单G点的计算结果就能说明很多问题，
，，
，所以我经常先用单g点声子谱计算粗略的试探其稳定性。
。。

e）我们进一步绘制投影声子谱来分析不同原子的贡献，
，，我们用vaspkit提取出来的数据有

就是按POSCAR顺序排布的
，
，，Zn,Zn,O,O的投影情况
。
。。。每个文件前两列为声子谱图像，，，后面为权重。。
。。此时我们只要选取一个Zn和O原子的文件
，
，，，即1
，，，3来画投影图即可。
。。。可将数据导入origin利用其权重气泡图功能，
，手搓半天绘制此图。。

但是，
，，经常面对大量材料的我们，，，手搓浪费生命
，，，现在向大家介绍我针对vaspkit后处理结果所写的外行看了嘬牙，，新手看了叹气，，，老手看了脑淤血的后后处理python制图脚本（上述普通声子谱也是用这个脚本画的，，，只要去掉散点图部分，，，重复两遍平平无奇部分）

此外，
，，当我们面对虚频时
，，我们还可以利用jmol查看虚频振动模式，，，
，甚至去提取他的虚频振动本征矢，，来确定虚频产生的振动方向，，，做一个微小的位移来进行能量曲线拟合，，，找到能量最小值的稳定结果，，称为“冻声子法”。。
。（脚本可以找“大鱼”获取）